一是節水灌溉新技術、新設備推廣力度小，噴、滴灌等高效節水灌溉技術目前也僅局限用于經濟作物，只是作為示范工程，有待于在更大范圍和更大規模推廣。

二是灌區和節水灌溉工程都存在不同程度的產權關系不明，管理職責不清，政事企不分，監督激勵機制缺乏，管理粗放、調度不靈活等問題。

三是受經濟利益影響，水資源相對充足地方的農民對搞節水灌溉積極性不高。

四是資金投入不夠，已建灌溉工程維護資金不足、老化失修，灌溉面積及灌溉效益逐年衰減和降低，新建節水灌溉工程建設資金短缺，特別是配套資金往往不到位，達不到應有的發展規模。

五是有些地方在推廣先進節水技術過程中不能夠因地制宜制定規劃，可行性論證不夠，存在針對性差的問題，致使有些節水工程不能正常發揮效益。

六是節水灌溉工程設備質量參差不齊，設備不配套，標準化、系列化程度差，維修服務跟不上。很多工程設備因質量問題或維護維修不及時等原因，導致工程使用壽命短，損壞率高等，影響了節水灌溉技術的推廣。